Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms