Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms