Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp49Q6P9L4 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms