Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3B9

Rbfa, Putative ribosome-binding factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RbfaQ6P3B9 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RbfaQ6P3B9 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms