Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms