Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Soga3Q6NZL0 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Soga3Q6NZL0 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Soga3Q6NZL0 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Soga3Q6NZL0 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Soga3Q6NZL0 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Soga3Q6NZL0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Soga3Q6NZL0 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Soga3Q6NZL0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Soga3Q6NZL0 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Soga3Q6NZL0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Soga3Q6NZL0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Soga3Q6NZL0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Soga3Q6NZL0 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Soga3Q6NZL0 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Soga3Q6NZL0 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Soga3Q6NZL0 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Soga3Q6NZL0 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Soga3Q6NZL0 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Soga3Q6NZL0 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Soga3Q6NZL0 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Soga3Q6NZL0 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Soga3Q6NZL0 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Soga3Q6NZL0 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Soga3Q6NZL0 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Soga3Q6NZL0 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Soga3Q6NZL0 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Soga3Q6NZL0 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Soga3Q6NZL0 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Soga3Q6NZL0 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Soga3Q6NZL0 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Soga3Q6NZL0 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Soga3Q6NZL0 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Soga3Q6NZL0 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms