Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms