Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX2

Krt42, Keratin, type I cytoskeletal 42, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt42Q6IFX2 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Krt42Q6IFX2 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Krt42Q6IFX2 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Krt42Q6IFX2 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Krt42Q6IFX2 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Krt42Q6IFX2 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Krt42Q6IFX2 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Krt42Q6IFX2 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Krt42Q6IFX2 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Krt42Q6IFX2 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Krt42Q6IFX2 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Krt42Q6IFX2 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Krt42Q6IFX2 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Krt42Q6IFX2 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Krt42Q6IFX2 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Krt42Q6IFX2 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Krt42Q6IFX2 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Krt42Q6IFX2 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Krt42Q6IFX2 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Krt42Q6IFX2 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Krt42Q6IFX2 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Krt42Q6IFX2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Krt42Q6IFX2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Krt42Q6IFX2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Krt42Q6IFX2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Krt42Q6IFX2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Krt42Q6IFX2 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Krt42Q6IFX2 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Krt42Q6IFX2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Krt42Q6IFX2 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Krt42Q6IFX2 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Krt42Q6IFX2 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Krt42Q6IFX2 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Krt42Q6IFX2 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Krt42Q6IFX2 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Krt42Q6IFX2 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Krt42Q6IFX2 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Krt42Q6IFX2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Krt42Q6IFX2 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Krt42Q6IFX2 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Krt42Q6IFX2 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Krt42Q6IFX2 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Krt42Q6IFX2 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Krt42Q6IFX2 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Krt42Q6IFX2 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Krt42Q6IFX2 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Krt42Q6IFX2 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Krt42Q6IFX2 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Krt42Q6IFX2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Krt42Q6IFX2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Krt42Q6IFX2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Krt42Q6IFX2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Krt42Q6IFX2 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Krt42Q6IFX2 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Krt42Q6IFX2 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Krt42Q6IFX2 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Krt42Q6IFX2 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Krt42Q6IFX2 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Krt42Q6IFX2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Krt42Q6IFX2 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Krt42Q6IFX2 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Krt42Q6IFX2 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Krt42Q6IFX2 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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