Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Carmil1Q6EDY6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Carmil1Q6EDY6 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Carmil1Q6EDY6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Carmil1Q6EDY6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Carmil1Q6EDY6 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Carmil1Q6EDY6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Carmil1Q6EDY6 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Carmil1Q6EDY6 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Carmil1Q6EDY6 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Carmil1Q6EDY6 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Carmil1Q6EDY6 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Carmil1Q6EDY6 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Carmil1Q6EDY6 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Carmil1Q6EDY6 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Carmil1Q6EDY6 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Carmil1Q6EDY6 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Carmil1Q6EDY6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Carmil1Q6EDY6 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Carmil1Q6EDY6 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Carmil1Q6EDY6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Carmil1Q6EDY6 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Carmil1Q6EDY6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Carmil1Q6EDY6 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Carmil1Q6EDY6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Carmil1Q6EDY6 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Carmil1Q6EDY6 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Carmil1Q6EDY6 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Carmil1Q6EDY6 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Carmil1Q6EDY6 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Carmil1Q6EDY6 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Carmil1Q6EDY6 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Carmil1Q6EDY6 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Carmil1Q6EDY6 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Carmil1Q6EDY6 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Carmil1Q6EDY6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Carmil1Q6EDY6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Carmil1Q6EDY6 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Carmil1Q6EDY6 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Carmil1Q6EDY6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Carmil1Q6EDY6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Carmil1Q6EDY6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Carmil1Q6EDY6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Carmil1Q6EDY6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Carmil1Q6EDY6 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Carmil1Q6EDY6 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Carmil1Q6EDY6 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Carmil1Q6EDY6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Carmil1Q6EDY6 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Carmil1Q6EDY6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Carmil1Q6EDY6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Carmil1Q6EDY6 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Carmil1Q6EDY6 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Carmil1Q6EDY6 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Carmil1Q6EDY6 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Carmil1Q6EDY6 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Carmil1Q6EDY6 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Carmil1Q6EDY6 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Carmil1Q6EDY6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Carmil1Q6EDY6 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Carmil1Q6EDY6 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Carmil1Q6EDY6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms