Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cep290Q6A078 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms