Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZP3

Pnkd, Probable hydrolase PNKD, mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnkdQ69ZP3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PnkdQ69ZP3 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms