Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZJ7

Ric1, RAB6A-GEF complex partner protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ric1Q69ZJ7 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ric1Q69ZJ7 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ric1Q69ZJ7 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ric1Q69ZJ7 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ric1Q69ZJ7 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ric1Q69ZJ7 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ric1Q69ZJ7 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ric1Q69ZJ7 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ric1Q69ZJ7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ric1Q69ZJ7 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ric1Q69ZJ7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ric1Q69ZJ7 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ric1Q69ZJ7 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ric1Q69ZJ7 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ric1Q69ZJ7 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ric1Q69ZJ7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ric1Q69ZJ7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ric1Q69ZJ7 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ric1Q69ZJ7 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ric1Q69ZJ7 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ric1Q69ZJ7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ric1Q69ZJ7 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ric1Q69ZJ7 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ric1Q69ZJ7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ric1Q69ZJ7 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ric1Q69ZJ7 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ric1Q69ZJ7 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ric1Q69ZJ7 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ric1Q69ZJ7 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ric1Q69ZJ7 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ric1Q69ZJ7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ric1Q69ZJ7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ric1Q69ZJ7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ric1Q69ZJ7 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ric1Q69ZJ7 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ric1Q69ZJ7 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ric1Q69ZJ7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ric1Q69ZJ7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ric1Q69ZJ7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ric1Q69ZJ7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ric1Q69ZJ7 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ric1Q69ZJ7 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ric1Q69ZJ7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ric1Q69ZJ7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ric1Q69ZJ7 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ric1Q69ZJ7 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ric1Q69ZJ7 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ric1Q69ZJ7 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Ric1Q69ZJ7 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ric1Q69ZJ7 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ric1Q69ZJ7 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ric1Q69ZJ7 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Ric1Q69ZJ7 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Ric1Q69ZJ7 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Ric1Q69ZJ7 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ric1Q69ZJ7 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ric1Q69ZJ7 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ric1Q69ZJ7 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Ric1Q69ZJ7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ric1Q69ZJ7 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ric1Q69ZJ7 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ric1Q69ZJ7 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ric1Q69ZJ7 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ric1Q69ZJ7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ric1Q69ZJ7 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ric1Q69ZJ7 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ric1Q69ZJ7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ric1Q69ZJ7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ric1Q69ZJ7 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ric1Q69ZJ7 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ric1Q69ZJ7 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ric1Q69ZJ7 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ric1Q69ZJ7 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ric1Q69ZJ7 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ric1Q69ZJ7 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ric1Q69ZJ7 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ric1Q69ZJ7 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ric1Q69ZJ7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ric1Q69ZJ7 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ric1Q69ZJ7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ric1Q69ZJ7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ric1Q69ZJ7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ric1Q69ZJ7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ric1Q69ZJ7 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ric1Q69ZJ7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ric1Q69ZJ7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ric1Q69ZJ7 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ric1Q69ZJ7 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ric1Q69ZJ7 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ric1Q69ZJ7 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ric1Q69ZJ7 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ric1Q69ZJ7 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ric1Q69ZJ7 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ric1Q69ZJ7 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ric1Q69ZJ7 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ric1Q69ZJ7 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ric1Q69ZJ7 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ric1Q69ZJ7 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ric1Q69ZJ7 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ric1Q69ZJ7 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms