Protein–RNA interactions for Protein: Q64291

Krt12, Keratin, type I cytoskeletal 12, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt12Q64291 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.2 ms