Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms