Protein–RNA interactions for Protein: Q62217

Sema5a, Semaphorin-5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5aQ62217 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema5aQ62217 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema5aQ62217 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema5aQ62217 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema5aQ62217 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema5aQ62217 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema5aQ62217 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema5aQ62217 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema5aQ62217 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema5aQ62217 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema5aQ62217 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema5aQ62217 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema5aQ62217 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema5aQ62217 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema5aQ62217 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema5aQ62217 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema5aQ62217 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema5aQ62217 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema5aQ62217 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema5aQ62217 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema5aQ62217 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema5aQ62217 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema5aQ62217 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema5aQ62217 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema5aQ62217 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema5aQ62217 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema5aQ62217 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema5aQ62217 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema5aQ62217 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema5aQ62217 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema5aQ62217 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema5aQ62217 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema5aQ62217 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema5aQ62217 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema5aQ62217 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema5aQ62217 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema5aQ62217 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema5aQ62217 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema5aQ62217 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema5aQ62217 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema5aQ62217 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema5aQ62217 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema5aQ62217 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema5aQ62217 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema5aQ62217 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema5aQ62217 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema5aQ62217 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema5aQ62217 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema5aQ62217 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema5aQ62217 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema5aQ62217 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema5aQ62217 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema5aQ62217 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms