Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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SnrpaQ62189 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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SnrpaQ62189 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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SnrpaQ62189 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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SnrpaQ62189 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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SnrpaQ62189 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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SnrpaQ62189 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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