Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sema3cQ62181 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema3cQ62181 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sema3cQ62181 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema3cQ62181 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema3cQ62181 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Sema3cQ62181 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Sema3cQ62181 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema3cQ62181 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sema3cQ62181 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sema3cQ62181 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sema3cQ62181 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema3cQ62181 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms