Protein–RNA interactions for Protein: Q62059

Vcan, Versican core protein, mousemouse

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Length 3,357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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VcanQ62059 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VcanQ62059 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VcanQ62059 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VcanQ62059 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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VcanQ62059 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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VcanQ62059 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VcanQ62059 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VcanQ62059 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VcanQ62059 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VcanQ62059 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms