Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms