Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms