Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Neurod1Q60867 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Neurod1Q60867 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Neurod1Q60867 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Neurod1Q60867 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Neurod1Q60867 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Neurod1Q60867 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Neurod1Q60867 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Neurod1Q60867 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Neurod1Q60867 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Neurod1Q60867 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Neurod1Q60867 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Neurod1Q60867 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Neurod1Q60867 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Neurod1Q60867 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Neurod1Q60867 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Neurod1Q60867 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Neurod1Q60867 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Neurod1Q60867 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Neurod1Q60867 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Neurod1Q60867 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Neurod1Q60867 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Neurod1Q60867 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Neurod1Q60867 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Neurod1Q60867 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Neurod1Q60867 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Neurod1Q60867 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Neurod1Q60867 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Neurod1Q60867 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Neurod1Q60867 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Neurod1Q60867 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Neurod1Q60867 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Neurod1Q60867 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Neurod1Q60867 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms