Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Slc6a4Q60857 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Slc6a4Q60857 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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