Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp13a3Q5XF89 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms