Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms