Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 AV099323-201ENSMUST00000124336 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tsr1Q5SWD9 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms