Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ankrd40Q5SUE8 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms