Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psme4Q5SSW2 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms