Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms