Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

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Length 617 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SynaQ5G5D5 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SynaQ5G5D5 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SynaQ5G5D5 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SynaQ5G5D5 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SynaQ5G5D5 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SynaQ5G5D5 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SynaQ5G5D5 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SynaQ5G5D5 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SynaQ5G5D5 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SynaQ5G5D5 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SynaQ5G5D5 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SynaQ5G5D5 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SynaQ5G5D5 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SynaQ5G5D5 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SynaQ5G5D5 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SynaQ5G5D5 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SynaQ5G5D5 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SynaQ5G5D5 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SynaQ5G5D5 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SynaQ5G5D5 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SynaQ5G5D5 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SynaQ5G5D5 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SynaQ5G5D5 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SynaQ5G5D5 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SynaQ5G5D5 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SynaQ5G5D5 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SynaQ5G5D5 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SynaQ5G5D5 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SynaQ5G5D5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SynaQ5G5D5 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SynaQ5G5D5 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SynaQ5G5D5 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SynaQ5G5D5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SynaQ5G5D5 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SynaQ5G5D5 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SynaQ5G5D5 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SynaQ5G5D5 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SynaQ5G5D5 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SynaQ5G5D5 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SynaQ5G5D5 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SynaQ5G5D5 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SynaQ5G5D5 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SynaQ5G5D5 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SynaQ5G5D5 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SynaQ5G5D5 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SynaQ5G5D5 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SynaQ5G5D5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SynaQ5G5D5 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SynaQ5G5D5 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SynaQ5G5D5 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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