Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms