Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rtl5Q5DTT4 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rtl5Q5DTT4 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rtl5Q5DTT4 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rtl5Q5DTT4 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rtl5Q5DTT4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rtl5Q5DTT4 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rtl5Q5DTT4 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rtl5Q5DTT4 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rtl5Q5DTT4 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rtl5Q5DTT4 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rtl5Q5DTT4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rtl5Q5DTT4 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rtl5Q5DTT4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rtl5Q5DTT4 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rtl5Q5DTT4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rtl5Q5DTT4 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rtl5Q5DTT4 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rtl5Q5DTT4 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rtl5Q5DTT4 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rtl5Q5DTT4 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rtl5Q5DTT4 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rtl5Q5DTT4 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rtl5Q5DTT4 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rtl5Q5DTT4 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rtl5Q5DTT4 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rtl5Q5DTT4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rtl5Q5DTT4 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rtl5Q5DTT4 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rtl5Q5DTT4 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rtl5Q5DTT4 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
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Rtl5Q5DTT4 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rtl5Q5DTT4 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rtl5Q5DTT4 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rtl5Q5DTT4 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rtl5Q5DTT4 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rtl5Q5DTT4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rtl5Q5DTT4 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rtl5Q5DTT4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rtl5Q5DTT4 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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Rtl5Q5DTT4 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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Rtl5Q5DTT4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rtl5Q5DTT4 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rtl5Q5DTT4 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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Rtl5Q5DTT4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rtl5Q5DTT4 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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Rtl5Q5DTT4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rtl5Q5DTT4 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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Rtl5Q5DTT4 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rtl5Q5DTT4 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rtl5Q5DTT4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rtl5Q5DTT4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rtl5Q5DTT4 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rtl5Q5DTT4 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rtl5Q5DTT4 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
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Rtl5Q5DTT4 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rtl5Q5DTT4 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rtl5Q5DTT4 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rtl5Q5DTT4 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rtl5Q5DTT4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rtl5Q5DTT4 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rtl5Q5DTT4 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rtl5Q5DTT4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rtl5Q5DTT4 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rtl5Q5DTT4 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rtl5Q5DTT4 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rtl5Q5DTT4 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rtl5Q5DTT4 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rtl5Q5DTT4 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Rtl5Q5DTT4 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rtl5Q5DTT4 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rtl5Q5DTT4 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rtl5Q5DTT4 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rtl5Q5DTT4 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rtl5Q5DTT4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rtl5Q5DTT4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rtl5Q5DTT4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rtl5Q5DTT4 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rtl5Q5DTT4 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rtl5Q5DTT4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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