Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufaf2Q59J78 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms