Protein–RNA interactions for Protein: Q571H0

Urb1, Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb1Q571H0 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Urb1Q571H0 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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