Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms