Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 3,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dnah12Q3V0Q1 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dnah12Q3V0Q1 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dnah12Q3V0Q1 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dnah12Q3V0Q1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dnah12Q3V0Q1 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dnah12Q3V0Q1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dnah12Q3V0Q1 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dnah12Q3V0Q1 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Dnah12Q3V0Q1 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dnah12Q3V0Q1 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dnah12Q3V0Q1 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dnah12Q3V0Q1 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dnah12Q3V0Q1 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Dnah12Q3V0Q1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dnah12Q3V0Q1 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dnah12Q3V0Q1 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dnah12Q3V0Q1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dnah12Q3V0Q1 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dnah12Q3V0Q1 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Dnah12Q3V0Q1 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dnah12Q3V0Q1 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dnah12Q3V0Q1 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Dnah12Q3V0Q1 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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Dnah12Q3V0Q1 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Dnah12Q3V0Q1 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dnah12Q3V0Q1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Dnah12Q3V0Q1 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dnah12Q3V0Q1 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dnah12Q3V0Q1 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Dnah12Q3V0Q1 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dnah12Q3V0Q1 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Dnah12Q3V0Q1 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Dnah12Q3V0Q1 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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Dnah12Q3V0Q1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Dnah12Q3V0Q1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dnah12Q3V0Q1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dnah12Q3V0Q1 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dnah12Q3V0Q1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Dnah12Q3V0Q1 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dnah12Q3V0Q1 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Dnah12Q3V0Q1 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dnah12Q3V0Q1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dnah12Q3V0Q1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dnah12Q3V0Q1 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dnah12Q3V0Q1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Dnah12Q3V0Q1 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Dnah12Q3V0Q1 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Dnah12Q3V0Q1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnah12Q3V0Q1 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Dnah12Q3V0Q1 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnah12Q3V0Q1 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnah12Q3V0Q1 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnah12Q3V0Q1 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnah12Q3V0Q1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnah12Q3V0Q1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnah12Q3V0Q1 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnah12Q3V0Q1 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnah12Q3V0Q1 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnah12Q3V0Q1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnah12Q3V0Q1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnah12Q3V0Q1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnah12Q3V0Q1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnah12Q3V0Q1 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnah12Q3V0Q1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnah12Q3V0Q1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnah12Q3V0Q1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnah12Q3V0Q1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnah12Q3V0Q1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dnah12Q3V0Q1 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dnah12Q3V0Q1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dnah12Q3V0Q1 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Dnah12Q3V0Q1 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dnah12Q3V0Q1 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dnah12Q3V0Q1 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dnah12Q3V0Q1 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms