Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp48Q3V0C5 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp48Q3V0C5 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp48Q3V0C5 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp48Q3V0C5 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp48Q3V0C5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp48Q3V0C5 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp48Q3V0C5 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp48Q3V0C5 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp48Q3V0C5 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp48Q3V0C5 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp48Q3V0C5 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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Usp48Q3V0C5 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp48Q3V0C5 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp48Q3V0C5 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp48Q3V0C5 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp48Q3V0C5 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp48Q3V0C5 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp48Q3V0C5 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp48Q3V0C5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp48Q3V0C5 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp48Q3V0C5 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp48Q3V0C5 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp48Q3V0C5 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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Usp48Q3V0C5 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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Usp48Q3V0C5 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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Usp48Q3V0C5 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp48Q3V0C5 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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Usp48Q3V0C5 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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Usp48Q3V0C5 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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Usp48Q3V0C5 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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Usp48Q3V0C5 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp48Q3V0C5 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp48Q3V0C5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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Usp48Q3V0C5 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp48Q3V0C5 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp48Q3V0C5 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp48Q3V0C5 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp48Q3V0C5 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp48Q3V0C5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp48Q3V0C5 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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Usp48Q3V0C5 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp48Q3V0C5 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp48Q3V0C5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp48Q3V0C5 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp48Q3V0C5 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp48Q3V0C5 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp48Q3V0C5 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
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