Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc27Q3V036 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms