Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms