Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms