Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Znf48Q3US17 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Znf48Q3US17 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Znf48Q3US17 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Znf48Q3US17 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Znf48Q3US17 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Znf48Q3US17 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Znf48Q3US17 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Znf48Q3US17 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Znf48Q3US17 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Znf48Q3US17 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Znf48Q3US17 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Znf48Q3US17 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Znf48Q3US17 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Znf48Q3US17 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Znf48Q3US17 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Znf48Q3US17 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Znf48Q3US17 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Znf48Q3US17 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Znf48Q3US17 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Znf48Q3US17 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Znf48Q3US17 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Znf48Q3US17 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Znf48Q3US17 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Znf48Q3US17 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Znf48Q3US17 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Znf48Q3US17 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Znf48Q3US17 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Znf48Q3US17 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Znf48Q3US17 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Znf48Q3US17 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms