Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms