Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms