Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cog7Q3UM29 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms