Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp19Q3UJD6 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms