Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB9

Edc4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc4Q3UJB9 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Edc4Q3UJB9 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Edc4Q3UJB9 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms