Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms