Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms