Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip13Q3UA06 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms