Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q3U6N9 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Q3U6N9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q3U6N9 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q3U6N9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q3U6N9 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q3U6N9 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q3U6N9 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q3U6N9 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q3U6N9 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Q3U6N9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Q3U6N9 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Q3U6N9 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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