Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnf40Q3U319 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Rnf40Q3U319 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Rnf40Q3U319 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Rnf40Q3U319 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Rnf40Q3U319 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Rnf40Q3U319 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf40Q3U319 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf40Q3U319 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf40Q3U319 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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